Факультет (военных сообщений) является ведущим учебным подразделением института, на котором ведется подготовка специалистов для Департамента транспортного обеспечения МО РФ.
В сентябре 1975 года вместо существовавших до этого сводных курсантских батальонов различных специальностей наряду с другими факультетами был создан командный факультет Военных сообщений.
Организационно в структуру факультета стали входить кафедры Военных сообщений, Военной эксплуатации железных дорог, железнодорожных станций и подвижного состава, Военной эксплуатации водного и воздушного транспорта.
К концу 1980-х годов командный факультет Военных сообщений прочно занимал в училище ведущие позиции.
Выпускники факультета в процессе прохождения службы занимали высокие должности в органах военных сообщений и других органах управления, руководили воинскими коллективами, выполняли сложные задачи, связанные с организацией массовых воинских перевозок, проявили себя в вооруженных конфликтах, в том числе в Афганистане и Чеченской республике.
С 1988 по 1994 год подготовка офицеров для Службы военных сообщений осуществлялась в рамках батальонной системы организации процесса.
В 1994 году в составе Военно-транспортного института Железнодорожных войск и военных сообщений вновь образован факультет «Военных сообщений», который представляет собой учебное подразделение, включающее 4 кафедры и 4 курсантских батальона.
В 2004 году по предложению Президента Российской Федерации Путина В.В. выпускник училища по специальности Военная эксплуатация железнодорожного транспорта 1973 года полковник запаса Левитин Игорь Евгеньевич был назначен Министром транспорта РФ.
С 2007 года факультет продолжает обучение и воспитание курсантов на новой учебной базе в г. Петродворец.
С сентября 2014 года личный состав факультета размещается в стенах нового курсантского общежития, в котором созданы все необходимые условия для комфортного проживания курсантов.
На факультете осуществляется многопрофильная подготовка высококвалифицированных офицеров для Департамента транспортного обеспечения МО РФ, Железнодорожных войск, ФСБ РФ и стран СНГ по специальностям: Применение подразделений по эксплуатации железных дорог и Организации военных сообщений и воинских перевозок.
Занятия с курсантами проводятся в оборудованных наглядными пособиями, персональными компьютерами и техническими средствами обучения в аудиториях и кабинетах. Навыки практической работы по специальности отрабатываются на Учебно-тренажерном комплексе Эксплуатации железных дорог, оборудованном погрузочно-выгрузочными площадками и устройствами, подвижным составом, образцами военной техники, учебными классами и местами в оборудованных действующими пультами управления и связи специализированных лабораториях и кабинетах, а также на реальных транспортных объектах – железнодорожных станциях, в вагонных локомотивных депо.
Совершенствование профессиональных навыков будущих офицеров отрабатывается при прохождении производственной практики и войсковой стажировки. Стало правилом организовывать их на объектах транспорта и в комендатурах военных сообщений, выполняющих значительные объемы воинских перевозок.
Эффективное обучение курсантов достигается поддержанием на факультете высокого внутреннего порядка, воинской дисциплины и службы войск, созданием необходимых условий жизни, быта и досуга курсантов, всесторонним информационным обеспечением, культурным и патриотическим воспитанием. В курсантских подразделениях постоянно организуются коллективные посещения музеев, театров и концертных залов, проводятся встречи с ветеранами факультета, института и органов военных сообщений.